如何选购一款适合自己的荧光定量PCR仪
荧光定量PCR 因操作方便、运行速度快、实验结果准确,受到越来越多的分子生物学研究者青睐。在实验技术成熟的今天,也许对你来说,最难得不是实验技术上的问题——而是选择哪一种荧光定量PCR仪——你要征询实验室成员的意见、分析实验室目前乃至将来的需求、平衡实验室的预算,更要详细研究各种极富诱惑力的宣传资料。面对各种不同性能的产品,您又该如何选择呢?
首先建议大家走出认识荧光定量PCR的两个误区:
误区一:仪器通道越多越好
随着PCR技术的成熟运用,多重扩增越来越热闹,荧光定量PCR仪也不能幸免。从最初ABI公司推出的单通道荧光定量PCR仪发展到如今各个厂家都推出4通道、5通道甚至6通道荧光定量PCR仪,眼花缭乱的选择让人无所适从,就有人一不小心走进了“通道越多越好”的误区。
在使用有些厂家5通道的荧光定量仪时,为了确保实验结果的精确性和准确性都要在实验中使用ROX(一种荧光染料)或专用的Reference dye ,这些荧光染料都必须单独使用一个检测通道。这样以来,真正能检测多重PCR荧光信号的有效通道只有4个,而且使用校正染料可能会增加后期的使用成本。有的荧光定量PCR的检测通道是只为自已厂家的专用的荧光染料或试剂开放的,有效检测通道也绝非像宣传资料中宣称的那么多。在购买前确认荧光定量PCR仪器的有效检测通道尤为重要,不能单单只听宣传。
考虑多重荧光定量PCR的通道数的时候也应该从实验室实际情况出发,多重PCR并非人人适用、人人可用,因为它使实验复杂化了,况且大多数实验室荧光定量实验常年只使用SYBRGreen一种染料,实在没有必要选购更多通道。
误区二:real-time PCR仪无需梯度功能
对于使用染料法的定量PCR反应,虽然有各种各样的PCR引物设计软件或者经验公式计算熔解温度(Tm值),但运用的公式不同、引物序列不同,Tm值的差异会很大。引物的熔解温度决定了退火温度。而且模版中碱基的组合千变万化,对于特殊片断,经验公式得到的数据不一定能得出准确的结果,退火温度细微的差异对结果都可能产生决定性的影响,因而“摸条件”一度是让人很头疼的问题。梯度PCR的出现部分解决了一些问题——在反应过程中每个孔的温度控制条件可以在指定范围内按照梯度变化,根据结果,一步就可以摸索出最适合的反应条件。
不单退火温度,连变性温度和延伸温度都可以优化——对于多种聚合酶混合酶扩增的多数高保真Taq酶来说这个非常重要,因为Taq和校正酶的最佳反应温度可能有显著差异,优化延伸温度就显得很重要。
使用有梯度功能的荧光定量PCR可以一次完成以往多次实验才能完成的优化过程,简化了摸索 PCR反应条件的繁琐实验,既节省实验时间提高效率,又节省实验成本。
当我们走出误区,想要选择一款最适合自己需求的荧光定量PCR仪时我们又该关注些什么呢?
开始前,先扪心自问:
实验目的是什么?
仪器的检测通量有要求吗?
如果灵敏度高,重复性好,速度快是不是很帅?
还有一点万万不可忽略……
兜里有多少钱?!
建议各位老师从以下方面考虑选购荧光定量PCR仪:
仪器的通量(一般做基因表达研究的,选择96孔的足够)
硬件设计特点(从光路系统,软件操作,试剂耗材是否开放考虑)
运行速度(决定升降温速度方面考虑)
灵活性(从升级和更换模块考虑)
讲真,其实你没必要那么累
古语有云,“磨刀不误砍柴工”,挑选仪器是一件苦差事。可是,时间有限,世界上有那么多仪器,即使不停地搜索仪器知识,能了解的数量也十分有限。这种情况下就不得不学着做一些筛选,通过一些技巧和方法,最终提升自己的效率。
难道为了找一台适合自己的荧光定量PCR仪,不懂原理?没事,搜!不懂如何保养?没事,搜!结果,天天研究,挤占了时间不说,最终找来的仪器可能还不尽如人意。
所以,在行动之前,不如好好规划,咨询一下惠友生物,只需一个电话、一封邮件就可以轻松搞定!
现在为大家推荐一款性价比超高的荧光定量PCR仪:
产品简介
来自德国耶拿的全新一代荧光定量基因扩增仪qTOWER3系列,整台仪器一体化设计,采用独特的4个高效LED固态光源作为激发光源,并通过专利性的光纤扫描系统来采集荧光信号,确保市面上常用的荧光定量PCR染料都能得到出色稳定的激发和检测。灵活的检测通道配置,升级方便,最高可实现六重目的基因的同时检测。耶拿公司具有近三十年的基因扩增仪研发制造历史,快速且耐用的镀金纯银样品槽使其96孔温度均一性达到± 0.15 ℃。选配的12列线性温度梯度功能使用户能快速确定最佳的PCR退火温度进而优化反应条件,是用户优化PCR程序的得力助手。它具有开放的试剂和耗材系统,适用于标准的96孔PCR板、8联管或者PCR单管。
一、创新点:
1、快速:最大升温速度可高达8 ℃/s,最大降温速度6 ℃/s,是目前市面上升降温速度最快的定量PCR仪,能明显节约实验时间,提高工作效率;
2、便捷:通道自由选择,节省预算,享受最新性能;使用操作方便,告白繁琐;
3、中文软件界面:为了方便越来越多中国用户的使用,特开发了中文软件界面,让用户在享受高质量结果的同时还享受到直观方便的使用体验;
二、先进的温度控制系统
1、快速反应:镀金纯银样品槽,半导体Peltier加热,最大升温速率为8℃/s,热导性好,且耐腐蚀抗氧化
2、精准控温:温度准确性为±0.1 ℃,96孔的温度均一性为±0.15 ℃,精准的温度控制带来稳定且特异性好的扩增效果
3、线性温度梯度:独特的12列线性温度梯度功能,能帮助用户快速找到最精准的退火温度(适用于qTOWER3 G)
4、自动热盖:采用先进的自动热盖技术,仪器自动控制热盖的高度和压力,确保有效的防蒸发效果
5、耗材开放:对耗材没有特殊要求,用户可自由选择96孔板、8联管或单管,使用方便
三、独特的光学检测系统
1、高强度宽光谱的激发光源:采用蓝色、绿色、红色、白色(RGBW)四个高强度长寿命LED固态光源,确保在整个光谱检测范围内都有很强的光强,提高检测灵敏度,而且使用时无需预热,光源不发热,使用寿命长,终身免维护
2、高灵敏度检测器:新型的通道式光电倍增管检测器(CPMT),是目前应用到定量PCR仪上检测灵敏度最高的检测器
3、快速扫描检测:8道光纤扫描检测快速,即使完成六通道的96孔整板扫描,也只需要6s
4、无需光路校正:扫描检测能确保每孔的信号激发和检测光程都完全一致,无需光路校正,因此无需额外占用一个校正通道,可实现真正的六通道基因检测。当然,如果用户希望采用内参染料校正,可同样可以实现
5、检测通道配置灵活:用户可根据需求灵活选择通道数和各通道的检测滤光片组, 有12种不同波长的滤光片组可选择以配置成1-6通道的检测系统,包括滤光片错配的FRET检测组合和专用于蛋白熔解曲线分析的滤光片组,覆盖从蓝光到红光的全光谱,通道数可以随时方便升级,以满足未来更多的检测需求
四、实用方便的操作分析软件
qTOWER3 荧光定量PCR仪的操作和分析软件qPCRsoft,能满足荧光定量PCR的各种应用要求,如具有绝对定量、双标准曲线法相对定量、双Delta Ct法相对定量(结合扩增效率分析)、熔解曲线、等位基因分型/SNP分析、终点法分析、扩增效率计算等分析方法,可以提供符合MIQE标准的实验报告,实现实验报告信息化管理和实验信息的溯源,是研究基因表达分析、病原体定量检测、SNP基因分型、阴/阳性判定等的强有力工具。
1、仪器运行过程中,可实时动态显示扩增曲线、Ct值等结果信息
2、可以在运行程序后再定义样品孔,节省实验时间
3、运行程序时可以同时打开其他实验数据结果进行查阅分析
4、根据实际的荧光信号强弱不同,可通过调节检测增益值来优化信号强度
5、软件自动计算基线范围和自动设置阈值线,给用户提供可靠准确的数据结果
6、具有多基因分析、多板分析等功能,对于多种目的基因、多个样品板等相对比较复杂的分析检测也可轻松处理
7、在进行多重基因检测时,光学补偿功能可校正各通道间的信号交叉干扰,提供更为准确的检测结果
8、扩增图、标准曲线图、熔解曲线图等可直接复制或另存文件,数据结果可直接导出到Excel中进行分析和保存
9、实验程序设置信息及检测结果可直接打印成实验报告
10、同一批实验的结果可以分组进行独立的数据分析,最多可分成12个组
11、可以提供符合MIQE标准的实验报告,实现实验报告信息化管理和实验信息溯源
12、提供中文软件界面,极大地方便了中国用户的使用
13、可直接在仪器自带的10英寸超大触摸屏上进行程序设置和运行,运行过程中可实时显示扩增曲线和Ct值信息,结果可方便导入到电脑中
14、软件可以无限制安装在多台电脑上,无需付费购买使用权限,终生可免费升级
15、蛋白熔解曲线分析
专门的蛋白滤光片组,其激发光波长490nm,发射光波长580nm,正适用于用SYPRO Orange荧光染料标记进行蛋白熔解曲线分析,在检测蛋白热稳定性、优化蛋白结晶配体和缓冲液条件、分析蛋白相互作用等方面有独到之处。
五、高性能带来高质量的检测结果
卓越的温度控制系统和高灵敏度的光学检测系统,为用户带来准确可靠的检测结果。
宽广的线性检测范围
扩增检测人类基因组DNA的某一特定基因,基因拷贝数从100-109共10个数量级,通过标准曲线检测,软件自动计算出其R2 0.999,扩增效率为100%。
杰出的检测重复性
扩增E.coli某特异性的基因序列,96孔间的Ct值标准偏差SD为0.07。
反应体系大小适用性强
qTOWER3对于扩增反应体系大小没有特殊要求,5-80 μl的反应体积都可以得到稳定准确的结果,体积大小对检测结果无影响。单孔反应体积分别为5 μl、10μl、20μl、30μl、40μl、50μl、60μl、70μl、80μl