孙悟空本是一上古顽石，在花果山之巅屹立了上千万年，吸收了天地日月之精华，遇到风而化为石猴，一问世不久，孙悟空就顿悟了生死，出海寻仙谋求长生不老之道。孙悟空从东胜神州出发，飘洋过海来到南赡部州，在南赡部州呆了十年后，发现没有大能，失望地从南赡部州启航，飘洋过海近半年来到西牛贺州，恰巧不偏不倚地在灵台方寸山脚下登陆，经过樵夫指引，爬到了斜月三星洞。
菩提祖师有知前后地神通，早预测到孙悟空要来，派仙童出门相迎。
就这样，菩提祖师与孙悟空戏剧性地相遇了，之后菩提祖师用七年时间磨练孙悟空心性，用三天时间，教会孙悟空七十二变，筋斗云和太品天仙诀，八九玄功等法术。
关于菩提祖师地本来面目，坊间流传着各种各样地说法，其中一种说法，笔者觉得颇有意思，那就是：菩提祖师的本来面目，是通天教主。
当年商纣王在女娲宫大不敬，引起了女娲不满，接着引出封神大战，封神大战鸿钧祖师徒的三个弟子都参与了，元始天尊和太上老君在伐纣阵营，通天教主在商纣王阵营。
通天教主摆出最强大的诛仙镇被破后，心里愤愤不平，最后决定重炼地水火风，再开世界，求反败为胜，就在通天教主想要毁灭世界之际，鸿钧祖师徒出场了，他先是喝斥元始天尊和太上老君，让他们放下武器各回道场，接着带着通天教主离开，将通天教主禁闭了。
然而，有网友们认为，通天教主还是放不下这口恶气，被关禁闭前，留下一个分身，分身就是菩提祖师，通天教主不想暴露这个分身，所以菩提祖师很是神秘。
菩提祖师教孙悟空，就是要让孙悟空去大闹天宫，这算是通天教主给元始天尊和太上老君的一个警告，就像是在说：“我还会回来的
