自从帕伯丁议长推翻共和制，建立帝国后，整个宇宙都笼罩在黑暗的阴影下。邪恶的帝国将无数的星系置于令人窒息的恐怖统治中。绝地武士们尽了最大的努力，但是依旧没能抵挡住黑暗势力的侵袭。无数的绝地武士在反抗中牺牲了，只剩下一小部分人躲过了灾难，隐居在宇宙的角落里，等待着打败西斯的那一天。终于，帝国的间谍们锁定了Kashyyyk的一个坐标，一名绝地武士就藏身于此。随即，西斯武士达斯维达被派往那里，去消灭这名绝地。
序章 Ksshyyyk
帝国巨大的战斗母舰到达了这个边缘的星系，无数帝国战斗机和登陆艇拖拽着火焰从母舰中起飞，进入了Ksshyyyk的大气层。曾经绝地的忠实盟友——猿人们拿起了武器，奋起抵抗帝国的侵略。顿时，这个美丽的星球上燃起了无数的战火和硝烟。拥有重武器的帝国克隆人军团很快便占据了上风，猿人们在强大的火力压制中纷纷倒下。
一架巨大的运输机从天而降，机舱缓缓打开，里面透出一股令人窒息的力量。达斯维达缓缓走出机舱，克隆人指挥官急忙上前迎接。
“报告维达陛下，我们在登陆的过程中遭遇了埋伏，不过局面已经控制住……”
话还没说完，克隆人指挥官便感觉透不过气，暴躁的维达已经用强大的原力掐住了他的脖子：“我对你所说的局面没有任何兴趣，我到这里来是有我自己的使命。”话音一落，这个倒霉的克隆人指挥官便倒在了地上。
达斯维达径直朝着猿人的建筑走去。见到维达前来，又一名克隆人指挥官上前报告：“维达陛下，我们找到绝地的藏身处了，就在前面！”
“很好，带我去找他，指挥官。”
“是！”克隆人指挥官转向背后的杂鱼，“你们几个也跟着过来。”
在巨大的骆驼战斗机器的掩护下，克隆人军团顺利推进到了绝地武士的藏身处。刚打算冲锋的克隆人军团，却突然遭到了猿人们最后的激烈反抗。顿时，不熟悉地形的克隆人先头部队溃不成军，急忙撤退至掩体。
“陛下，我们遭遇了激烈的抵抗，无法前进！”
“我们还不能完全摧毁它们的战线！”
“交给我吧。”达斯维达的面具里透出了这几个令人胆寒的词。他独自一人走出了掩体，向着目的地走去。
“回去吧，黑暗君主！”维达的背后突然传出一个坚定的声音，“我不管你要找什么，不过，这里没有你想要的东西！”
维达没有马上回头，他感觉到，刚刚说话的正是他奉命来解决的绝地武士。
“在我面前就别躲躲藏藏了，绝地。”维达猛然回头，用强大的原力掀翻了面前的建筑物。
“大家快找东西抓紧！”绝地武士对藏在建筑物里的猿人喉道。但是无济于事，整个建筑物开始坍塌。绝地武士灵敏地跳出了建筑物的废墟，亮出了自己的蓝色光剑。
“是时候做一个了结了，西斯！”
“你就来试试吧！”维达的红色光剑也发出了嗡嗡声。
曾经的荣耀，还有被变成半机器人，需要靠面罩呼吸的耻辱，顿时化成了对绝地的无比仇恨。维达一跃而起，用愤怒的剑术不断攻击对面的绝地武士。
在曾经最强的武士达斯维达的进攻下，很快，绝地武士便招架不住了。维达乘绝地疲于防守之际，突然使出原力夺取了对方的光剑，顺势将失去武器的绝地打倒在地。
“我感到附近还有一股更强大的原力，是你的师傅吧，他在哪里？”维达冷冷地问。
“你忘了吗，黑暗的武士，几年前，你亲手杀了我师傅。”
“是么？我杀的绝地太多了，记不清了。不过既然这样，就让你们师徒团聚吧。”维达举起了手中沾满绝地的鲜血的红色光剑。
突然，一股力量将维达手中的红色光剑夺走了！维达顿时吃了一惊。转头一看，什么啊，原来只是一个小孩子。
“快跑！”绝地对着那个孩子大喊。但是，那个孩子岿然不动，他朝着维达举起了刚夺来的光剑。几个克隆人士兵连忙过来护驾。
维达轻松用原力取回了光剑，砍倒了用激光木仓瞄准孩子的那几个克隆人士兵：“跟我走吧，孩子。”随后杀害了落败的绝地武士。
第一关 Nar Shaddaa
转眼间，几年过去了，当年的那个孩子，已经成长为了一名强大的西斯武士。在帝国巨大的母舰中，主角单膝跪在达斯维达的面前：“师傅，找我有什么事情吗？”
“我第一次遇到你的时候，你很弱小，不过，经过我多年的培养，你已经成为了一名西斯了。现在，黑暗原力将是你的武器。平身，我的弟子。”
主角站了起来，走近维达：“有什么需要我去做的？”
“你的训练已经快要完成了，现在，你需要去接受一个真正的考验。”
“难道又发现绝地武士了？”
“是的，是Rahm Kota大师。他正在进攻帝国的一个船坞，现在那里正处于危险之中。去杀掉他，然后把他的光剑带来交给我，这就是你的第一次考验。”
“我这就出发，师傅。”
“等等，我的弟子。杀掉那里的所有人，不管是帝国军还是Kota的叛军。”
“遵命，师傅。”
主角来到了母舰的机库，准备登机。一个工程机器人正在工作，看到主角后，它转过身：“主人，你的飞行员已经就位了。她已经通过了帝国的训练。”
“我是Juno Eclipse上校，出生于Corulag星球。”
“她是帝国最年轻的飞行员，曾被皇家学院录取。”多嘴的机器人跑过来，变成了女机长的外形，插嘴说，“后来经历了100多次战斗，指挥了Callos的战斗，逐步晋升，现在被派来执行最高机密任务。”
“你知道你为什么在这里吗？”主角问年轻的Juno。
“是的，我的任务很明确，就是确保飞机载着你去任何地方，直到执行完你的任务。”
“维达告诉过你他把上一个飞行员杀了吗？”
Juno 摆了摆手：“我只能设想，他给了维达一个杀他的好借口，但是我不会。”
“但愿如此，我早已厌烦了不断训练新的飞行员。”
运输机向目的地飞去，主角正在思索着自己的任务：“Proxy，告诉我目标的情况吧。根据陛下的记载，Kota大师是一名受人尊敬的将军。”
Proxy接到命令，立刻变成了Kota大师的外形。这个看似丑陋的机器人，事实上能够靠折射光线自由变换自己的形态。“主人，Kota大师是一个军事天才。他觉得克隆人士兵不适合作战，他只信任自己身边的士兵。所以，剿灭绝地武士的66号指令下达时，他身边没有一个克隆人士兵。后来，他便失踪了。帝国的官方资料称他已经死了。”
“那么他为什么要突然出现，而且袭击帝国的军事设施呢？”Juno不解地问。
“他想引起帝国的注意吧。”主角带着猜测的口气回答。
“那就麻烦了。在我之前死了多少飞行员了？”
“7个。”
“很好。我锁定到目标了，准备超光速飞行。”
一阵亮光袭来，运输机进入了超光速飞行。一会儿便到达了目标船坞。“船坞的损伤非常严重！”Juno不禁惊讶地喊出声来。
“接近船坞，准备降落。”主角做好了迎战的准备。
此刻，在船坞中，Kota大师正在对他的部队进行部署：“锁定指挥中心，把全息图放映机打开，让它运转。然后，所有的部队散开，布置成一个漏斗，吸引我们的敌人进来。炸药的等级设置为2，5，12，按照原计划进行！”
“是，将军！”Kota的部队指挥官打开了全息图。图象上，一个光点正在朝船坞驶来，“将军，他在那里！”
“很好，终于找到你了。”Kota低声自言自语道。他已经想好了对策。“打开12号机库放他进来，大家各就各位吧。”
Juno机长搜索着船坞没被破坏的机库，“12号机库可用，准备降落。”
运输机刚落地，主角从机舱中一跃而出，瞬间被砍到了几个守备人员。一个士兵被主角强大的原力抓起，丢向了墙壁，摔得动弹不能。主角走上前去，用脚踢了一下呻吟着的士兵：“Kota在哪里？告诉我。”
“为什么要告诉你？反正不管如何我都是死。”
主角手一台，就用原力将这个士兵举到了半空中，然后开始掐他的喉咙。那个士兵很快便受不了了：“我说……我说……求你饶了我，Kota……在……在……控制室……”
咔擦一声，士兵的脖子被原力折断，随后被狠狠摔在了地上。
主角径直向控制室走去。一路上遇到了一些守备的士兵，但他们完全不是主角的对手，纷纷倒地。
控制室就在里面吧，主角看了看封闭的铁门上的标示，随后运足原力，一下子轰开了控制室的大门。Kota虽然已经在里面等候多时了，但看到主角后不免吃了一惊：“一个男孩？哈哈哈，我袭击帝国的目标已经几个月了，维达就派这么一个毛孩子来打倒我？”
“孩子，我曾遇到过比现在坏几百倍的情况，你真的以为你能打倒我？”
主角没有回答，他亮出了自己的红色光剑。
“既然这样，那就对不起了，孩子。”Kota的剑柄射出一道绿色的光束。
一场恶战展开了。Kota大师用强大的原力，搬动着控制室里的各种器械砸向主角，主角灵敏地躲避着攻击，趁着一丝破绽，他使出了西斯闪电，将Kota击倒在地。
但是身经百战的Kota大师迅速起身：“孩子，看来你比我想象的要强大，但是，到此为止了，既然是你逼我的，我就让你知道原力的强大！我甚至可以把整个工厂举起来砸到你的头上！”
“那就尽管来吧！”
瞬间，Kota便将控制室的器械全部连根拔起，一齐向主角压过来。主角躲闪不及，被巨大的控制台砸到控制室的墙角。
“结束了！”Kota大叫一声，举起光剑冲向墙角。
突然间，墙角的控制台碎片四溅，碎片中主角一跃而起，红色光剑划过Kota的腰部，Kota惨叫着倒地。主角飞奔而来，一剑劈了下去，被Kota用光剑勉强架住。
此时的Kota气喘吁吁，已经没有反击的力量了。两根交叉的光剑不断在Kota的眼前蹦出火花。“年轻人，维达以为他改造了你，但是我能看到你的未来……维达不会一直是你的师傅的，我看到的，是……”
还没等Kota说完，主角便用臂力把Kota招架的光剑压向Kota的脸，Kota的脸部瞬间被灼伤。一声惨叫后，双手捂脸的Kota被主角用原力举了起来，砸向了控制室的玻璃壁。随着玻璃的碎裂，Kota被抛出船坞，飘向了真空。
主角捡起了Kota掉落的光剑：“Juno，任务完成了，我们回去。”
第二关 The Jedi Temple
主角回到了达斯维达的跟前：“师傅，我回来了。”
“Kota大师死了？”维达没有回头，冷冷的问。
“是的。”
“那么我叫你带回来的光剑呢？”
主角低下头，刚准备取光剑，光剑已经自己飞了出去，被维达握在手中。维达透过漆黑的面具，仔细端详着曾经的战友的光剑，突然，他打开了光剑的开关，一道绿光刺向主角的颈部，停在了离主角只有一寸的地方。
“你精神太不集中了！”维达训斥道：“这么容易就被别人取走光剑！刚刚如果是别人取走你自己的光剑，你现在已经死了！现在，去绝地神庙，你的修行还不够，我的弟子。”
“是，师傅。”主角向机库走去。维达没有转头看他，他不禁想起了当年，就是这个孩子夺去自己的光剑。
绝地神庙处于美丽的Coruscant，曾经是绝地修行的地方。不过，自从剿灭绝地叛乱的战火洗礼，神庙已经破败不堪了。
主角的运输机降落在了神庙前面的广场上，守备的克隆人立刻上前阻止：“这个地区已经被皇帝陛下封锁了，任何人不得入内，赶快驾驶你的运输机离开这里。”
随后，守备的克隆人们便倒下了。主角收起了光剑，向神庙内走去。
从前富丽堂皇的神庙内部，如今已是一片废墟，四处都是断壁残垣。主角用原力推开了废墟，向神庙纵深走去。
这是主角第一次来神庙。神庙中央巨大的雕塑，虽然历经沧桑，但依然给人一种庄严肃穆的感觉。主角仿佛听到了神像在诉说： “在这里，你需要使出所有你能想到的所有生存技能。控制恐惧，放下愤怒。”
突然，废墟中出现了一个人影：“1000名绝地武士的死亡，会召唤出噩梦的Darth Desolous。”原来是盘踞在神庙内的西斯武士，很少见地，他不仅有西斯的红色光剑，还有一面巨大的盾牌。
“很快，你也会恐惧地叫着我的名字了，年轻人。”Desolous做出了进攻的姿态。
主角的光剑也发出了嗡嗡声，两名西斯武士扭打在一起。Desolous的特制盾牌，竟然能够完全防御光剑的强大能量，面对对手强大的进攻和没有缝隙的防御，主角陷入了苦战，多次被打倒在地。
究竟该如何取胜？主角陷入了迷茫。控制恐惧，放下愤怒，对，只有这样才能取胜。主角开始冷静对抗着对手的进攻。
“去死吧！”
Desolous急速向主角冲过来，主角并没有做任何防御动作，他全神贯注，将原力提升到了最高，向对手攻了过去！
Desolous 急忙举起盾牌防御，但是这股原力的强大远超他的想象，他被推向了背后的神像，重重撞了上去。主角迅速冲上前，抓住Desolous，摔到了地上。此时的 Desolous已经摔得眼冒金星。主角跳上神像的肩膀，一下子推到了神像。巨大的神像轰然倒下，Desolous甚至没来得及惨叫，便已被压成肉酱了。
同样已经筋疲力尽的主角，对着神像喘着粗气。这时，机器人Proxy摇摇晃晃走了过来。
“Proxy，你来这里做什么？”
Proxy变成了维达的外形，主角连忙跪下。 “我的情报人员找到了一个绝地，但是我不指望你能活着回来。Kazdan Paratus比你强大的多。但是，如果你打败了他，你将离你的目标更近一步。”
“让我去吧，师傅！”
“是的，我们联手就能打败他。去吧，我的弟子。”
“我不会让你失望的，师傅。”
第三关 Raxus Prime
主角一行人接受命令后，向Raxus飞去。由于这里金属遍地，看起来这是一颗金黄色的星球，进入大气层后，他们见到了一个古老的建筑。“那和绝地神庙还真相似呢。”Juno自言自语道。
由于这颗古老的星球似乎没有现代文明，所以宫殿周围找不到降落的地方，Proxy也收不到有价值的电子信号，只有一些乱七八糟的机器人的呻吟。运输机停在了离宫殿有段距离的空地，主角独自一人下了飞机，向宫殿走去。
废墟中的路还真不好走，到处都是破旧的机器人的残骸。突然间，主角背后的残骸从地上站了起来。到底是怎么回事？不容多想，主角立刻干掉了这些复活的机器人。
途中还有一些体型较大的复活机器人，不过在强大的西斯武士的面前，根本不足为惧。通过坑道后，主角发现当地的土著正和机器人们战斗。一阵乱砍后，土著和机器人纷纷倒下。
主角抓起了一个奄奄一息的土著。“别杀我……求你别杀我……我不想死……Drexl,Drexl! 如果你不杀我，他会……他会帮助你……”随后，他被主角丢向了火药箱。一声巨响，这个可怜的土著灰飞烟灭了。
“我自己去确认吧。”主角朝着那堆灰烬自言自语，随后向深处走去。
面前是几个土著的首领模样的人：“Drexl命令我们欢迎你。听说你被那些机器人招待了？”
“是的，但我的情况看来比你们好。”主角回敬了一句，“我要找到Kazdan Paratus。”
土著们听了好像很高兴的样子：“啊，我们会帮助你的，找到那个绝地武士。，但是价格嘛……”
话还没说完，主角就永原力抓起了那个领头的土著：“这里没有谈判的余地。”
“他在神庙里，他在神庙里……”
主角没时间管这些贪婪的土著，像神庙走去。突然，那些土著又出现在了主角的后面，刚刚差点被掐死的土著头领大笑道：“把你交给帝国的话，我会得到很多钱吧。不过，在这之前，我要先教训你一顿！”
土著头领拿出了自己的特制金属剑，它能够格档下光剑的攻击。后面的土著纷纷举起了激光木仓，瞄准了主角。
“你以为你能做到吗？”主角的光剑打开了。一眨眼，土著杂碎们就全灭了。
“别得意，”土著头领拿着金属剑冲了过来，“吃我一剑！”
不过这种程度的战斗力完全不是主角的对手，主角一下子掀翻了土著。这时，一个土著驾驶飞机向主角撞来，妄图偷袭。主角一跃而起，跳上了飞机，用原力将飞机调了头，撞死了土著头领。
还没来得及喘气，一个巨大的机器人便推开了废墟的墙壁，抄着大斧子攻了过来：“你居然敢来绝地神庙？你居然敢在这绝地的领土上挑战绝地武士？哈哈哈，你真是个傻子！”
一击就能切断巨大岩石的臂力，让主角完全无法正面迎战。不过经历了这么多和机器人的战斗，主角很快看出了对手的特点。
主角用西斯闪电控制住的机器人的行动，然后迅速闪到了机器人的背后，用光剑刺向驾驶室。驾驶室爆 炸了，但爆 炸前，一个矮小的身影飞了出来。
“你太傻了，居然来到绝地神庙，就让我在这里了结你吧！”原来，这就是藏身于此的绝地武士。说罢，这个长相奇怪的绝地武士便打开了自己的双头光剑。
“是的，我来到了这里。而且，杀了你之后，我还将摧毁这个神庙。”主角毫不畏惧冲向了对手！
由于体形很小，所以主角的光剑很难刺中这个身手敏捷的对手。但是很快，主角便发现对手对原力的控制比较弱。Kazdan Paratus刚用原力控制一块机器人的碎片，准备砸向主角，主角用更强的原力将碎片顶了回去，把身材矮小的Kazdan Paratus砸在神柱上。然后，强大的西斯闪电彻底将对手最后的抵抗能力剥夺。
Kazdan Paratus奄奄一息躺在地上：“大师们，我再一次让你们失望了。”随后，他慢慢合上了眼睛。
“Juno，任务完成了，准备起飞。”
回到母舰，主角来到了维达面前：“师傅，我已经杀死了Kazdan Paratus。我已经准备好了，我的训练该完成了。”
“不，你只是打败了一个老头和一个无家可归的人。”维达的话泼了主角一头冷水，“你还有很多考验，现在，去绝地神庙，不要让我失望。”
第四关 The Jedi Temple
主角又回到了绝地神庙。很明显，这里加强了戒备。主角刚一到来，守备的克隆人部队蜂拥而至。但是主角仅用手轻轻一推，这些士兵便被弹得东倒西歪。
走进神庙，主角又听到了这个熟悉的声音：“现在还不晚，不要让你自己被愤怒蒙蔽了双眼。试着用你的感觉找出真相。”
正当主角聆听时，里面的克隆人部队也找到了主角。
“抓住他，他在这里！”克隆人指挥官大喊。
当然，这些都是徒劳，主角毫不费力来到了神庙中央，却看到Juno正蹲在地上观察着什么。
“Juno，你怎么会在这里？”主角疑惑地走上前，“去运输机上等我。”
突然，Juno转过身，恶狠狠对主角说：“你要学得还多着呢！”随后，出现在主角面前的，是一张狰狞的脸。面前的，正是西斯武士Darth Phobos。
“看着你恐惧的脸，真让人沉醉呢。”这位女性西斯用挑逗的语气戏弄着主角。
愤怒的主角立刻拔出了光剑，两位西斯之间顿时刀光剑影，火花四溅。交手两个回合后， Phobos发现面前的对手并不是这么容易对付的。她使出了绝招，战场上出现了她的分身。
同时和两个分身交战，主角渐渐开始招架不住，一个疏忽，被Phobos用原力重重弹到了墙壁上。“你能看到自己的过去，你也能看到自己没有将来！”
两个Phobos慢慢走上前来：“结束了，年轻人！我感到了你的孤单，愤怒，恐惧，而且我将知道你最恐惧的是什么。”
主角的耳边回响起了那句话：“不要让你自己被愤怒蒙蔽了双眼。试着用你的感觉找出真相。”他闭上了眼睛。他用心看到了神庙内的一切，看到了拿着光剑朝他走来的那个真正的Darth Phobos。
“我没有过去！我无所畏惧！”主角以肉眼难以捉摸的速度冲向了那个Phobos。另一个Phobos也冲向了主角，但是主角没有理会她，一剑刺向了用心看到的那个Phobos。假的Phobos瞬间消失了。
随后，Phobos的真身被主角用原力不断砸向四面的墙壁。Phobos连站立的力气都没有了。她变成了Juno的模样求饶：“请，请别杀我……”
一道光束穿过了Phobos的身体。看来，主角并没有接纳她的提议。
“干得好，我的徒弟！”维达突然出现在神庙，“现在你已经可以面对一位真正的绝地武士了，Shaaki Ti大师，绝地长老会最后的幸存者之一。想要击败她，你必须使出全部的黑暗力量。”
说完，维达的形象消失了。原来，那是Proxy带来的口信。
第五关 Felucia
“探测器说这个星球有生命的迹象。”Juno向主角报告。
“你瞒得了别人，瞒不了我，你心里藏着什么？”
