巫山十二峰是巫峡当中最著名的景点。十二峰为：登龙峰、圣宗泉、朝云峰、神女峰、松峦峰、集仙峰、净坛峰、起云峰、飞凤峰、上升峰、翠屏峰和聚鹤峰。（其中净坛峰、起云峰、上升峰隐于岸上山后，在船上见不到。）十二峰中最为美丽动人的是神女峰、有关仙女瑶姬的为民除害、协助大禹治水、并化做神女峰石，永保三峡航路平安的传说，更使神女峰蒙上了一层神秘的色彩。
　　传说在很久很久以前，长江巫峡南岸翠屏峰下的青石洞里，住着十二条蛟龙。一天，这十二条恶龙窜出了山洞，搅得巫峡上空天昏地暗，百姓们被大风卷上了天空，房屋树木被飞沙走石打得稀烂，人畜死伤无数。这时，西王母的小女儿瑶姬正好从东海云游归来，她驾着彩云路过巫山上空时，看到十二条恶龙为非作歹，十分生气。瑶姬用手一指，天上响起了惊天动地的炸雷，把十二条恶龙炸成了千万段碎尸，纷纷落下地来。 
　　可是，恶龙的碎骨堆成了一座座崇山峻岭，利刃般的山峰直插云霄，填满了河谷，堵塞了水道。江水急剧上涨，淹没了村庄、田野和城镇，眼看就要把四川变成一片汪洋大海了。瑶姬情急之中想起了治水英雄大禹，连忙驾云去找大禹来帮忙。
　　大禹听说后，一口气赶到巫山。他挥舞神斧，驱赶神牛，不停地开山疏流。谁知恶龙化成的山石坚硬无比，怎么也劈不开。瑶姬被大禹治水的精神感动了，又邀请她的姐姐们下凡来帮助大禹开凿河道。她还回到天宫，向王母娘娘搬兵求救。王母十分疼爱她的小女儿，就趁玉皇大帝午睡的时候，到他的宝库中找到了《上清宝文理水》天书，授予了大禹。大禹得到宝书后，呼风唤雨，用雷炸，用电击，用水浇，很快劈开了三峡，疏通了积水，从此，四川变成了物产丰富的“天府之国”。 
　　大功告成之后，瑶姬本来是要回天宫去的，但是，她看到还有很多恶龙尸骨化成的顽石隐藏在江水里，形成了无数暗礁险滩，来往的船只经常被阻或触礁沉没。瑶姬放心不下，决定和她的十一个姐姐一起留下来，为船工们导航。天长日久，十二位仙女化作了十二座山峰，耸立在幽深秀美的巫峡两岸。这就是巫峡十二峰的来历。

海拔高度1130米，位于县城东15公里处的横石溪西侧。其山之高处，若一个昂首的龙头。"龙头"后的山势，又如起伏的龙身。 逶迤三十里，气势雄伟，层叠而起，象一条长龙跃跃欲飞，疑上九天。彩云缭绕峰间，长龙仿佛在空中狂舞，壮观之极。清朝诗人沈鸿逵写诗赞美登龙峰云：“极目层峦似卧龙，就中高处彩云丛。”
                                                                            圣泉峰


海拔高度870米，圣泉峰位于巫山县横石溪东侧与登龙峰各踞东西。又名大丹山。这里也有古诗赞云：“止水一泓澄道岸，飞流万派浸书田。”在其错落参差的山势中，有一个形若狮状的山头。山头前有一块银白色的光洁岩石，如同一块银牌挂在“雄狮”的颈上，当地人称之为：“狮子挂银牌”。峰下有一股长流不断的清泉，其味甘美清冽。泉随山势而下，好看之极。山以泉名，称为“圣泉峰”。

                                                                            朝云峰



海拔高度820米，位于江北的箭穿峡口，其峰势宏阔。每天清晨，日出之前，峰顶氤氲缥缈；日出之时，彩云环绕，时聚时散，变幻出各种图景，仿佛仙山，因而得名“朝云峰”，最妙的是云光彩霞。可领略到“除却巫山不是云”的神奇景色。古人咏此峰时写到：“看山可以咏今朝，最爱云峰在碧霄。不羡夕阳成彩笔，露浓五色半岩浇。”说出了朝云峰的云雾之奇。

                                                                            望霞峰（神女峰）


  海拔高度860米。是自然界最有诗意的一块石头。历代名篇多达？首。位于巫峡北岸，离县城30里处，西临朝云峰，东界松峦峰。峰顶内侧兀立着一个人形般的石柱，高6.4米，宛如一位婀娜多姿、亭亭玉立的少女，她明如秋水的眼睛，在那里望断长江、迎送舟帆。在巫山云雾缭绕中，更显得神奇而美丽。每当晨曦初露或夕阳西沉，这就是神话传说中的巫山神女瑶姬的化身——神女峰。关于神女峰的传说，在巫山广为流传。春秋战国时期，楚国伟大爱国主义诗人屈原作《九歌?山鬼》记叙了神女的故事。宋玉也在《神女赋》、《高塘赋》中记载了楚怀王与神女相会的情景。唐刘禹锡在《巫山神女庙》中也写下了“巫山十二郁苍苍，片石亭亭号女郎。晓雾乍开疑卷幔，山花欲谢似残妆”的句子。当然，这些众多的故事里，最动听的要数民间传说了。三峡人民为了纪念心目中的“神女”，尊她为“妙用真人”，并在飞凤峰旁修建了“神女庙”，把飞凤峰山腰的一个平台称为“授书台”。 “神女本是人间石”， 广大游客把她当成了“东方女神”是一点也不过份，因为她亭亭玉立在巫峡之巅，确实给游人许多联想和陶醉。
                                                                          松峦峰


海拔高度820米，松峦峰位于巫峡北岸、紧挨神女峰东侧。峰顶成圆形，苍松环盖，枝叶茂盛，形状象帽盒。又称帽盒峰。松峦峰以松盖峦得名，昔日古松遍地，莽莽苍苍，一片林海。每遇山风起，林涛阵阵，如潮如浪。人入其中，犹如置身惊涛骇浪的大海。若遇明月当空，松林静穆，归鸟倦睡，又有一番恬静的悠闲，如蹬仙界。古人作诗颇多，赞美此峰胜景。其中一首这样写道：“节彼层峦翠万重，何年蟠结几株松。苍烟日午高冲雁，老干春深欲化龙。啸雨半空声谡谡，吟风长峡韵淙淙，岁寒劲节历千古，不羡桃园挹露浓”。盛赞了古松遒劲耐寒的气节和松林的气势。

                                                                          集仙峰


海拔高度 840米。位于巫峡北岸，紧靠松峦峰东侧。 峰高入云，峰顶石林环列，参差矗立，如一群神仙相聚。故名集仙峰。又因峰顶自然分开一叉，恰似一把张开的剪刀，又称为剪刀峰。集仙峰的独特之处在于峰高峥嵘，石林环绕，极象九天众仙相聚之状。相传每年八月十五月明时，峰上有丝竹之声，猿鸣达旦，好象天宫古乐飘飘，猿啼鹤鸣，一派仙风道俗之景。峰旁因雨水长期侵蚀切割，形成深沟，更使峰势挺拔突出，直插云霄，又增加了它的神秘感。正如诗人描写的那样：“维石岩岩降列仙，置身高近五云边，不于蓬莱消灵蜕，来共巫峰证旧缘。”诗句惟妙惟肖地展现了集仙峰的美景。
江南六座（自西向东）

                                                                          飞凤峰


  海拔高度740米。位于南岸青石镇西，神女溪对岸。山势从西向东延伸，形如一只凌空翱翔的飞凤，直下江中饮水。因而得名飞凤峰。神女将一只金凤变成了一座山峰，留到了巫峡，成了一道美景，与神女朝夕相伴。这就是现在的飞凤峰。

                                                                            翠屏峰


　  海拔高度740米。位于江南岸，青石小镇的后面。此峰突起于缓缓山坡之下，漫山苍翠，郁郁葱葱，超然卓立，形如一道绿色的大屏风。因此得名翠屏峰。关于翠屏峰的美丽，也有历代诗人咏唱赞颂。其中一首较为典型：“巫山四面屏无二，却望东南欲滴翠。碧色分明云母光。清辉掩映琉璃器。”很形象地描绘了翠屏峰苍翠欲滴、五色斑斓的图画般景色。
                                                                           
                                                                            聚鹤峰


海拔高度820米。位于翠屏峰东面，峰顶怪石嵯峨，四时松杉茂密，长青不败。传说夜间有千百只白鹤聚集在此峰，故取名聚鹤峰。这些白鹤朝而往，暮而归，形成三峡的又一胜景。每当明月星稀或凄风冷雨之时，白鹤引颈长啸，与猿啼接应，最是消魂断肠的场景，使无数游子过客洒泪沾襟，思乡不已，产生了一种感伤。有诗曾经这样描绘此峰：“猿声巫峡愁漂泊，别有高峰招野鹤。松径兰崖任往还，雪翎砂顶相依托。”这诗刻画了聚鹤峰的景致和表达了游聚鹤峰的心情。

                                                                            上升峰


海拔高度780米。位于神女溪东岸6公里处，七里塘东侧。上升峰山势险峻峭拔，尖峰高突，巍然屹立。其一角斜上，飘飘欲飞，直上云霄，犹如巨鸟飞升九天。因此得名上升峰。又因峰形似鲲鹏展翅，扶摇直上，当地百姓又称它为老鹰岩。到达上升峰顶，可以远看万里长江，截断巫山云雨，一水奔腾，万峰峭拔。还可看到大宁河从莽莽群峰间穿行，犹如飘在群山间的银带。

                                                                            起云峰


　海拔高度720米。位青石镇东侧约8公里处，从蓝厂岩神女溪前行，过七里塘便到了起云峰。起云峰常年云雾缭绕，云雾常从山腰由下而上渐次腾起，变幻无穷，是观云海雾山的好去处。因此该峰取名起云峰。历代诗人描写此峰最多，如其中一首是这样描写的：“极目烟岚欲烧空，荡胸石壁疑翻水。地云云复起奇峰，变幻无端从此始”。由此可见起云峰的美妙壮观之处了。

                                                                            净坛峰　


海拔高度1020米。位于巫峡南岸神女溪南约5公里处的南广岩。离青石镇约15公里。万壑群山之向，一峰独秀而立，高数百丈，周长不过千米。山峰犹如一个静坐神坛之上默颂佛经的仙人。峰下有一泓清潭，水波微微，清洌甘甜，峰上有一个大平台，很象一处洁静的祭坛放在龙宫之上。取名净坛峰，有诗人赞美净坛峰：“三清世界翠微巅，谁筑仙坛不计年。自有层城瞻紫气，更无纤翳累丹田。” 为了永保百姓的安宁，观音菩萨就把空瓶放在七里塘上面，天长日久，空瓶就化作了一座山峰。老百姓遇到什么灾祸，只要在观音庙对面的空瓶山峰烧几柱香，磕几个头，灾祸就自然消除。久而久之，百姓年年朝拜，这里就变成了一个求神的法坛。