八年6次登顶，两个三连冠，芝加哥渴望能完成这一伟业，永远被后人铭记。赛季伊始，皮蓬因为脚部手术整整缺席了35场常规赛，不过托尼-库克奇很好地顶替了他的先发位置。虽开局仅8胜7负，但随后20场他们赢了16场，当皮蓬伤愈归来时，球队的战绩为24胜11负。
在新教头拉里-伯德的指挥下，印第安纳步行者在全明星周末开始时，竟领先公牛半个胜场差。不过公牛最终以62胜20负排名东部第一。乔丹赛季场均贡献28.7分5.8个篮板3.5次助攻，第5次当选为常规赛MVP，第10次成为联盟得分王；罗德曼以场均15.0个篮板的表现第七次成为篮板王；而伤愈归来的皮蓬也在后半程再现其全能选手的本色。步行者在雷吉-米勒，里克-史密斯和克里斯-穆林率领下，以58胜24负的佳绩排名东部第二，新教头拉里-伯德上任第一年就荣膺年度最佳教练。在大西洋赛区，热队以55胜27负蝉联赛区第一。
西部联盟，卡尔-马龙场均拿下27.0分10.3个篮板，虽然斯托克顿开始缺席了18场比赛，但爵士还是以62胜20负的战绩排名全联盟第一（同为62胜但常规赛爵士两场对公牛都取得胜利）。西部的另一支劲旅湖人在沙克-奥尼尔（场均28.3分11.4个篮板）、埃迪-琼斯、科比（场均15.4分）等天才球员的带领下，取得61胜21负的佳绩。西雅图超音速虽然送走了肖恩-坎普，但文-贝克很好地填补了他的空缺，再加上组织核心佩顿的稳定发挥，同样取得了61胜21负。圣安东尼奥马刺在该赛季得到年度最佳新秀蒂姆-邓肯（场均21.1分11.9个篮板2.51个盖帽），他和海军上将大卫-罗宾逊（场均21.6分10.6个篮板2.63个盖帽）组成双塔，带领马刺取得56胜26负，比上赛季整整多胜了36场，在爵士之后排名中西赛区第二。
季后赛阶段，公牛前两轮以3-0和4-1轻松淘汰网队和黄蜂，季候赛倒数第二轮，也就是东部决赛，对阵雷击-米勒的步行者，公牛和对手打了7场才分胜负，这是这么多年来的第一次。和公牛相反，西部犹他爵士的晋级之旅则是先难后易，他们在首轮以3-2扳倒休斯敦火箭后，4-1轻取马刺，4-0横扫湖人，早早就进入了总决赛，等候与公牛的再次对决。
总决赛前，4比0取胜的爵士整整休息了9天，七场大战后疲惫的公牛队中，罗德曼还遭受指伤困扰，于是，总决赛对阵信心满满的爵士队，赛前很多人都看好爵士会赢,而这一年的总决赛也成为NBA总决赛历史上少见的经典。
首场比赛乔丹得到了33分，但下半场他仅仅得到了13分，爵士的防守和同步行者的大战让乔丹有点疲惫，下半场的命中率也降低到了15投5中，乔丹的关键几次投篮不中最终让比赛进入到了加时。斯托克顿在比赛还剩下9.3秒时命中了致命的两次罚球，全场比赛斯托克顿得到了24分，但加时赛中他得到了7分。实际上在爵士和公牛的禁区得分相比为52-34，替补贡献为22-8，而爵士全场只有13次失误，最终爵士凭借主场优势88-85拔得头筹。
第二场，乔丹独得37分，公牛93-88将比分追平。第三场移师芝加哥，公牛凭借近乎完美的防守，让爵士的进攻完全乱了章法，公牛以96-54轻松胜出，54分也是NBA施行24秒进攻时限以来季后赛单场的最低得分。“这是比分么”，赛后爵士主帅斯隆握着技术统计表怒骂，“我以为是196分呢，看上去公牛得了196分”。杰克逊本场很好的利用了库克奇和皮蓬的防守天赋，尤其是皮蓬，他上半场几乎完美，先是独得10分帮助公牛49-31结束上半场，随后他攻防有效的限制了奥斯特塔格，比赛中他还两次抢断了给马龙的传球，而外线他还对斯托克顿进行严防，这让斯托克顿仅仅收获了2分，却出现了5次失误，而爵士全场的失误高达26次。
“防守端拥有皮蓬是我们的荣幸”，杰克逊说，“他能盯死任何和他对位的球员，同时还能帮助球队很快的布置好整体防守，这让爵士无法突破，斯科特有能力通过一人来遏制对手全队，今天他就做到了”。
第四场，乔丹得到34分，在还剩下2分11秒时他投中了两次关键投篮，而在内线罗德曼则将马龙赶到了场下。皮蓬本场有更好的发挥，他得到了28分9个篮板和5次助攻，公牛86-82再下一城，率先到达总决赛的赛点。第五场，背水一战的爵士依靠马龙的39分，83-81险胜公牛，将总比分改写为2-3，也将最终决战的赛场换至盐湖城。
1998年6月14日，公牛与爵士的总决赛第六场比拼在爵士主场如期上演。这场比赛，公牛开局即遭重创，皮蓬腰伤复发，比赛中两度离场接受治疗，全场比赛只得到8分，因此公牛的进攻重任全部落在了乔丹的身上。终场前41.9秒，双方战成83-83，斯托克顿在外线命中了一记关键的三分球，爵士86-83取得领先，似乎胜利已经在向他们招手，公牛几乎被判了死刑，第七场血战看来已经不可避免。正当爵士球迷欢呼雀跃之际，NBA总决赛历史上最经典的一幕开始上演，乔丹先是运球突破杰夫-霍纳赛克的防守，擦板上篮命中，将比分追至85-86。接下来爵士进攻，乔丹放弃防守霍纳赛克，悄然无声的移动到马龙的身后，将“邮差”手中的篮球夺走，公牛重新掌握球权，最后的机会留在了乔丹手中。
乔丹个人运球过场，他看到了史蒂夫-科尔被斯托克顿牢牢的看着，乔丹知道斯托克顿不会过来协防，这让他的防守对象只剩下拉塞尔一人。在三分线往里一步开始启动，他向右侧突破，拉塞尔紧跟不舍，在罚球线上方弧顶处，乔丹突然拉回重心，急停跳投，拉塞尔回身不及滑倒在地，时间在此刻似乎停止，篮球随着乔丹手腕的摆动缓缓滑入篮筐，宛如乔丹职业生涯的缩影，精美而曼妙。乔丹在球出手后，一直保持着投篮的姿势，仿似一尊撒满阳光的雄伟雕像，令人顶礼膜拜。这记中投是乔丹为公牛命中的最后一球，这粒进球让公牛87-86险胜爵士，八年内第六次夺得了NBA的总冠军，也完成了球队历史上的第二度三连冠。尽管此球并不是乔丹职业生涯的最终句号，但它却是乔丹在篮球场上书写下的永远令人震撼的惊叹号！经典不朽，熠熠生辉！
“当拉塞尔过来时，我出现了机会，我从来不怀疑自己也不怀疑比赛”，乔丹说。这记投篮和去年总决赛第一场的投篮极为相似，同样的主角和配角，同样的进球方式。
主帅杰克逊是乔丹各种辉煌时刻的见证者，他把1997年总决赛第五场乔丹带病砍下38分做为乔丹最好的比赛，而今天晚上的表演在禅师的心中排在了第二位。“真的不敢相信他的表现能超越比赛，他今天晚上确实是这样，这是在最关键形势下我见过最好的表演”，杰克逊说。
“如果有一天我离开了，我希望没有人会奇怪的看着我，觉得失去了什么，我还有其他的生活，希望大家能理解”，乔丹说。
在夺取第六座总冠军奖杯后，乔丹第二次宣布退役，公牛王朝的大幕就此落下，NBA从此进入了新的时代。
