在全民木仓战游戏背景中故事发生在数十年后的未来，一个藏有神秘物质的天外来客——一颗名为“天外核心”的陨石，降临地球，这起事件造成了上千人的死亡，并且引发了主流社会关于世界末日的极度恐慌。这次事件被官方称作“NT7-核心降落事件”。　
起初，人们只将它当做一颗普通的能够带来毁灭性灾难的陨石。但在了解到“天外核心”陨石中蕴含着一种神秘的气态金属“核心”(Core)后，别有用心的人为此不惜发动了战争。　
对人类来说，核心是一种超出他们理解极限的新型材料，它对人类的科技进步有着不可限量的价值，堪称21世纪最重大的科学发现。　
短暂的一年战争结束，战乱最终导致了旧人类势力的迅速衰退瓦解，并以联盟军、反叛者两大新兴势力各自瓜分了一半的核心而告终。人类原有的势力迅速瓦解，纷纷成为联盟军和反叛者的附庸。世界广大地区遭到战火波及，呈现一片颓败之象，人们将被天外陨石改变的地球戏称为“废土”。　
联盟军代表着人类中保守的旧科技和旧军事势力。联盟军的高层领导们认为，人类现有的科技对现代文明来说“已经足够了”，不需要借助外力的援助。他们自诩为正义的军队，以救世主的姿态出现在普通民众面前，并不断招纳雇佣兵作为其战斗力补充，力求一举击败反叛者军队。　
而反叛者们认为，核心科技是人类向高层次的文明进化的唯一动力源。反叛者由一群反社会的危险分子和疯狂科学家所组成，他们的信条是立即提高人类的科技水平而不惜一切代价，他们自认为世界的毁灭者和创造者，希望以天外陨石和核心科技的力量创造一个全新的世界……　
不同的理念导致了世界观的割裂。掌握了核心力量的联盟军和反叛者，迅速扩充其科技和军事实力，彼此虎视眈眈，不断在世界各个区域展开激烈的交火冲突，而在幕后不断支持着双方展开战争的，正是数个暗藏在黑暗中，控制着人类经济命脉的巨型财团……　
五年过后，联盟军和反叛者的战斗陷入了胶着状态。为了遏制战火的荼毒，世界原各大政治、经济组织的首脑在一位名为“本尼迪克特·拉蒙”的神秘人物支持下，参与并发动了著名的“本尼迪克特”运动，并最终迫使参战双方签订了限制滥用核心科技的《本尼迪克特法案》。　
法案规定，禁止将天外陨石带来的新型材料和科技使用在民用及军事领域，只允许联盟军和反叛者双方进行小规模的、仅限于实验室的科学研究。另外，法案还规定，如果联盟军和反叛者双方中的任一方增加了兵员数量和军费支出，另一方也有权利立即扩充军队以达到军力平衡。　
《本尼迪克特法案》一定程度上降低了人类对核心科技的使用率。但实际上，反叛者军方仍在暗中不断扩大对核心科技的滥用。甚至连联盟军内部，也在默许其下属的科技实验室开发核心科技相关的军事产品……　
人类对新科技的渴望，终究无法抑制。为了扩充战斗力，并且树立在人类群体中的形象，联盟军、反叛者双方展开了毫无止境的雇佣兵招募计划，任何一个成年地球人，都被允许加入雇佣兵组织，间接向联盟军和反叛者双方效力。雇佣兵享有高额的薪金和超过普通军人的待遇。他们也拥有诸多高级权限，能够自由出入普通民众禁止访问的军事设施、地下黑市和军火基地。其中一些高层的雇佣兵首脑，甚至拥有富可敌国的实力和足够发动一场战争的军火……　
雇佣兵势力和私募军队的势力激增导致了人类社会的混乱程度，在战争之余，雇佣兵们占用了大量公共资源，在人类社会中以一等公民自居。交战双方旗下的雇佣兵们，逐渐成为世界的重要力量。　
在漫长的对峙期后，联盟军和反叛者即将迎来最终决战。据天文学家预报，第二批来自外太空的陨石碎片，将在三个月后再度降临地球。这一次降临的核心陨石数量，估计是上一次NT7-核心降落事件的百倍之多。地球上的主要军事势力，在联盟军和反叛者之外，还有无数个小型的军事组织，都对新一轮的陨石降临虎视眈眈。世界大战即将爆发，联盟军、反叛者双方都做好了准备，他们坚信，这最后一战将决定人类的未来!　
人类的未来究竟在何方?是遵从天外核心的指导，迅速成为高科技种族?还是按照正常的发展轨迹，努力进化自己的文明?没有人能说得清除。决定这个世界命运的，只有两大势力旗下的战士们，这些被卷入战争漩涡的雇佣兵们，他们的战斗最终将使一切尘埃落定。