60年前，我上小学一年级。语文第一课课文是“鸡叫了，天亮了。”
两件事先后发生，可能有因果关系。一块砖砸脑袋，头被砸破。因在先，果在后。那末，鸡叫和天亮是不是因果关系呢？肯定不是！因为鸡不叫，天一样会亮。
如果有人说：“因为天亮，鸡才叫。天亮是因，鸡叫才是果。”这又与鸡叫先于天亮不符。这里就要研究为什么天亮前公鸡会叫？这涉及一门新兴的科学——生物钟。
公鸡成熟后会打鸣。这是先天性的，因为它具有生物钟。生物钟存在于绝大多数生物体，例如：含羞草叶子早开夜合、黑脉金斑蝶每年南迁、老鼠的夜间活动等。甚至原核生物类的光合细菌及真核生物类的粗糙链孢霉也是生物钟的研究模式生物。
人类的生物钟基因是PER2，而生物钟定位于下丘脑的“视交叉上核”。这是一簇管理生物行为节律性的神经细胞。科学家的研究，绘出了哺乳动物生物钟的调控系统：
光→视网膜→视交叉上核→神经-体液调节输出→中枢神经系统→外周节律
⊥丅↑
松果体→褪黑激素——————————————————┘
哺乳动物眼球中的神经节细胞负责生物昼夜节律的感光。鸟类、爬行动物、两栖动物、鱼类中，生物钟的感光细胞分布于身体多个部位，即使摘除眼球，仍有节律性行为。哺乳动物摘除眼球后，不但变盲，而且丧失昼夜节律。
视网膜接受光刺激后，信号经过“视网膜-下丘脑神经束”传导到视交叉上核，经过生物钟基因反馈作用调节松果体分泌褪黑激素的水平。褪黑激素的水平还可反过来抑制视交叉上核的电生理代谢活动。
生物钟是先天性的，但是生物钟节律是可以改变的：1.破坏小鼠的视交叉上核，它的发情周期、运动、饮食的节律都消失。2.时差适应：人在长途飞行后，按目的地时间调整光照和作息规律，生物钟会重新设置。因为地球自转方向，从东向西飞行后生物钟每天可调整约92分钟；而从西向东飞行后生物钟每天可调整约57分钟。3.改变光照规律，使生物改变节律。例如：改变光照规律，可以使昙花白天开放；养鸡场改变光照规律，可以使母鸡一天下两个蛋等等。
假如把一只公鸡放在密闭室内，改变光照规律，它就会重新调整打鸣时间。所以，“天亮”是因，“鸡叫”的时间是受“天亮”的影响而决定的。所以，因果关系必须研究其中的规律，不是谁前谁后的简单之事。
