在《西游记》中，元始天尊和菩提祖师都属于超级大佬级别的仙人，实力都非常强悍。但要说谁更厉害一点，这就要从两个方面去分析。首先，从元始天尊这个名字上去看，这是神话界中非常牛的称号，是一切的元始。

而且在道教传统中，元始天尊是最高神，甚至还有说法，说盘古就是元始天尊。所以，如果只以道教传统来比较，元始天尊是最高神，甚至就是盘古，那肯定没人是他的对手。菩提祖师自然也没有元始天尊厉害。

其次，从《封神演义》以及其他的网络小说中去分析，由于小说经过艺术修改，使得元始天尊的地位有所下降，比如就在元始天尊头上添了一个老师，叫鸿钧老祖。连本来传统中三清地位最低的太上老君成了元始天尊的大师兄，法力也在元始天尊之上。
所以从这个角度上来说，元始天尊和菩提祖师，应该是不相上下的，是能打个平手的。

最后，光从《西游记》的角度来说，元始天尊甚至地位不如玉皇大帝。而菩提祖师只是教了孙悟空几招，孙悟空就拥有闹天宫的本事。想想看，菩提祖师的修为自然非常高。

在如来佛祖降伏孙悟空的时候，元始天尊还受玉帝邀请，来祝贺如来佛祖，原著中提到：元始天尊向佛前拜献曰：“感如来无量法力，收伏妖猴。蒙大天尊设宴呼唤，我等皆来陈谢。请如来将此会立一名，如何？”

可想而知，元始天尊在《西游记》中又被弱化了不少。所以从《西游记》的角度来说，元始天尊并没有菩提祖师厉害，你说呢？