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哈佛大学宗教符号学教授罗拔.兰顿（汤姆·汉克斯饰演）到巴黎公干期间突然接到通知罗浮宫馆长遭人谋杀，而在博物馆内，尸体旁边留下了一个令人困惑的密码。兰顿教授与法国美女密码专家苏菲（柯德莉·塔图饰演）在整理分析谜团的过程中，惊讶地发现在达芬奇的作品中藏有一连串令人震惊的线索。这些线索人人可见，却被画家巧妙地伪装，加以隐藏。
兰顿教授发现这一连串的线索原来有着令人震惊的关联：已故的馆长是锡安隐修会的成员 －锡安隐修会是一个真实存在的秘密组织，其中成员包括牛顿、波提切利 (Botticelli, Sandro)、雨果和达芬奇等人。至此兰顿才发现自己正在追踪一个石破天惊的历史大秘密，一个已经埋藏了几个世纪、既富启发性又危险的秘密。在这场遍及巴黎、伦敦和苏格兰的追逐中，兰顿和苏菲发现自己正在跟一个从来不肯露面的幕后主脑斗智斗力，这个人似乎总是知道他们下一步要做什么。除非他们可以解开这个错纵复杂的谜团，否则一个埋藏了二千年的秘密、一个极爆炸性的古老真相，将永远消失，而他俩的性命亦会危在旦夕……
