正所谓自作孽不可活，人类发明出的Cylons人族群与人类为敌，且自己也发明出一批与人类一模一样的机器人作间谍渗入人类世界并瘫痪了人类的防御系统，摧毁了Battlestar舰队，用核武器将殖民地的城市化为灰烬。Battlestar Galactica是唯一一艘幸存的大型太空飞船母舰，在人类生死存亡之际其指挥带领几十艘各式各样的飞船和近5万名人类仅剩的幸存者逃离了殖民地的星系，开始了寻找人类的第13个殖民地－地球的旅程。这一悲壮的故事设定本身就十分符合诺亚方舟式的隐喻，更有趣的是剧组曾经设计了一款以达芬奇著名油画作品《最后的晚餐》为灵感的海报，无形中增添了影片的宗教色彩。

联邦星舰“航海家号”被一股神秘的外星力量送入了δ象限, 面对突如其来变故的船员们只能踏上一条漫长的返乡旅程。太空歌剧题材的设定之中，不难发现主角往往都是一艘类似诺亚方舟般的太空飞船，而在《航海家号》中，这种象征的意味更被无限放大。广阔的归乡之路，难以计数的艰难险阻，不同种族之间的交流与融合，团结一心排除万难的雄心壮志。从各种角度来说，“航海家号”的星际旅行与诺亚方舟所经历的故事颇为神似，共生共存，不畏艰难险阻都成为双方共有的精神内核。