北京时间5月10日，休斯敦火箭官方宣布姚明因伤退出季后赛，这对于他们与湖人的系列赛基本提前结束。本赛季火箭12年来首次打进入季后赛第二轮，完成了赛季前制定的任务，如果不是过多的伤病，可能火箭会走得更远。以下是本赛季火箭遭遇的伤病回顾：
巴蒂尔左脚受伤缺阵四周
季前赛中火箭的希恩-巴蒂尔左脚旧伤复发，使他休战了四周，他因此错过了前一个月的比赛，直到11月26日他在与步行者的比赛中才复出。
阿泰斯特脚踝休战9场
作为NBA有名的铁血战士，阿泰斯特基本上轻伤不下火线。他在1月2日与猛龙的比赛中左踝受伤，之后休战也与老鹰和76人的比赛。对阵凯尔特人的比赛中复出打了29分钟得17分，但是他感到仍然不舒服，连续休战了7场在1月25日复出。
姚明膝关节受伤
1月24日与步行者的比赛中，姚明第一节开始膝关节受伤，他在第二节打了5分钟后疼痛难忍，下半场没有再回来。他随后缺阵了与活塞的一场比赛，对阵76人再次复出。
麦迪提前报销
09年2月18日，休斯敦火箭战胜新泽西网队，但此时麦迪却通过ESPN宣布自己本赛季不会再回来，这给了火箭当头一击。麦迪本赛季之前在背靠背的第二场中肯定不上，他打打停停令球队上下不满，最终他选择了接受手术提前离开。火箭没有麦迪的情况下仍然打进了季后赛并且成功通过首轮。
兰德里遭木仓击
2009年3月17日，火箭打客场比赛连夜返回休斯敦，兰德里外出买饭时竟然遭遇不明木仓手袭击，他的小腿受到轻伤，他休战8场比赛后复出。
穆大叔提前退役
火箭与开拓者的第二场，穆托姆博在与奥登对位时倒地，他的左膝严重受伤，这使他本赛季提前退出，本来计划赛季结束后退役的穆托姆博只能提前说告别了，火箭季后赛内线少了一大支柱。
姚明左脚骨裂退出季后赛
火箭与湖人第三场中，姚明第二节左脚受伤，他一直坚持完打比赛。经过全方位检查，姚明需要静养8到12周时间，他提前告别了季后赛。
